Software - 

解析ソフトウエア

Products

​Metagenome@KIN

16S rRNA、ITS 
メタゲノム解析パッケージ

次世代シーケンスデータ解析ツール

​リード配列のBLASTまたは、PCR classifier実行後、菌種のグルーピングおよび階層分類を自動で実行。さらに、分類された結果を各種統計表示機能で比較することが可能。

​Metatranscriptome@KIN

メタトランスクリプトーム
​解析パッケージ

RNA-seqデータから、COG functional categoryの頻度解析を通じて試料中に存在する転写産物をモニタリング、発現タンパク質の機能とそれらタンパク質が作用しているパスウェイ、予測される代謝化合物を解析

​ROSALIND

RNA-seq, Chip-Seq
​専用解析ツール

Fastqファイルをアップロードするだけで、発現解析、Chip-seq解析を自動で実行し、small RNA、 NanoString nSolverデータにも対応しています

CLC Genomics Workbench

次世代シーケンスデータ
​総合解析ツール

NGS解析に要な解析ツールが一通り装備されており、ワークフロー機能で煩雑な解析を理解しやすいものとします。

ADPK Target
腎多発性嚢胞腎 "ADPKD"
​病原性変異解析ソフト

腎臓の希少疾病である常染色体優性多発性嚢胞腎(ADPKD)の病原性変異を解析するソフトとして開発されました。 ソフトではADPKDの病態を引き起こす2つの遺伝子”PKD1”および”PKD2”の変異を検出します。

​FluGAS
インフルエンザウイルス
HA, NA 亜型自動判定ソフト

配高速シーケンサによるインフルエンザウイルスゲノムシーケンスデータから簡単な操作でサブタイプ(亜型)の判定と分節ごとの塩基配列を決定するWindows用のソフトウェアです。

​OMIXON HLA Typing
HLA Typing解析ソフト
HAL Typing キット

次世代シーケンスデータ対応HLAタイピングに特化した解析ソフトHLA Explore、精度の高いプライマーセットのOmixon HLA Typing Kitを紹介しています。Exome / WGS / Pacbio / Nanopore データも解析可能

NEXUS CNV
ゲノムコピー数解析ソフト

ゲノムワイドの解析の手法であるゲノムコピー数解析のためのソフトウエアです。 マイクロアレデータまたは次世代シーケンスデータからの解析が可能です。すでに数多くの診断研究の場で利用されています。

NANO TOOLs
2.5世代シーケンスデータ
​解析ツール

オックスフォードナノポア、イルミナ対応 Windows上でデータ解析を実施。リファレンスマッピング、De Novo assemble、構造変異解析の機能を備えています。

PLA 3.0
​バイオアッセイ解析ソフト

EUおよびFDAに認められている様々なバイオアッセイデータ解析ソフトウェア。

バリデーションドキュメントも準備されています。

CoVGAS
​新型コロナゲノム解析

​NGS対応新型コロナウイルスゲノム配列けっていから、変異および近縁種株同定、毒性情報の表示などWindows上で実施可能

Data mining / ELN - 

ターゲット探索・安全性 / 電子ノート(LIMS)

LSKB
ターゲット探索

疾患からのターゲット探索、ターゲットやその機能を利用して適応疾患を検索、化合物からターゲットの予測やテキストマイニングを活用してさまざまな角度から求めたエビデンスをもとに正確なターゲット探索の環境を提供するソフトウエアです。

Chemotargets CLARITY
ターゲットプロファイリングと副作用予測

ヨーロッパのe-tox プロジェクト(http://www.etoxproject.eu/)の成果をもとに開発されたターゲット予測副作用予測ソフトウエアです。

OFF-X
副作用・毒性情報
データベース

毒性や安全性に関わる低分子医薬品や生物製剤の標的に対する作用についての情報を提供するアラートサービスです。

EXEMPLAR LIMS​
電子ノート
​LIMS機能

ELNを取り入れた新しいタイプのLIMSで、すでに米国外では製薬会社、クリニカル領域で多くの実績を持っています。​プロジェクト管理、サンプル管理、各種ワークフロー構築、NGS解析ワークフロー構築に適しています。

Services - 

​受託・解析サービス

S-KIN pro
皮膚菌叢解析​
​業界実績 NO1

次世代シーケンサーを利用したメタゲノム解析です。ヒト、動物の細菌・真菌を解析します。

​スワブキットの送付から、実験、解析、群間比較、クラスター解析まで含まれたパッケージです。

種レベルでの分析が可能です。

COMA PRO
口腔内細菌検査
​世界初 口腔内細菌DB構築

次世代シーケンサーを利用した口腔内細菌に特化した解析を実施します。ペーパーポイントまたは唾液キットを送付、実験解析、口腔内に特化した細菌DBとの比較など実施します。

その他微生物・真菌解析
腸内細菌、各種16s rRNA、ITS 解析受託

次世代シーケンサーを利用のメタゲノム解析受託です。すでに多くの実績を出しています。解析には弊社ソフトmetagenome@KINを利用し、さらにオプション解析では要望に応じた解析を実施します。​生データからの解析受託も行います。

データ解析受託
次世代シーケンスデータ解析、マイニング解析

次世代シーケンサーからのデータ、論文情報、創薬情報、化合物情報などマイニング技術を利用したアノテーションサービス、詳細解析、マイニングサービスを実施します。

​様々な要望に対応できますので、まずはご連絡ください。