OmniTier CompStor® － NGS 2次・3次解析用システム
本製品は研究用途専用です
オンプレミスまたは
エッジ環境下のゲノム解析
-
インターネット接続必要なし
-
最高峰の診断率、より正確なバリアントコール
-
解析にかかる全体費用の低減
-
オンプレミスでの保管によるデータの完全な保護
キャンペーン
C2
遺伝性疾患・がん疾患-2次・3次解析受託サービス開始キャンペーン
OmniTier社のCompstorを利用した遺伝性疾患およびがん疾患を対象とした2次、3次解析の受託サービスを開始いたします。
受託サービスをご利用になることで、解析にかかる時間とコストを削減し、より早く解析結果を得ることが可能となります。
Pac Bio社や、オックスフォードナノポア社のデータにも対応しております。
初回受託サービスをご利用時にキャンペーン価格をご利用いただけます。
サービス内容
FastQファイルから2次、3次解析
WGS,WES 1検体 通常 50,000円 ー＞＞キャンペーン価格 35,000円+消費税
Amplicon 1検体 通常 35,000円 ー＞＞キャンペーン価格 24,500円+消費税
VCFファイルからの3次解析
WGS,WES 1検体 通常 35,000円 ー＞＞キャンペーン価格 25,000円+消費税
Amplicon 1検体 通常 15,000円 ー＞＞キャンペーン価格 10,000円+消費税
各種解析例のご紹介
特徴
CompStorは２次解析・３次解析と変異レポートを出力します
シーケンス
入力
Short Read - Illumina
Short Read - MGI
Long Read - PacBio
Long Read - ONT
FASTQ
uBAM
２次解析
VCF
BAM
３次解析
-
患者レポート
-
GWAS解析
-
Privateデータベース作成
-
可視化及びバイオマーカー探索
カタログダウンロード
Insight Oncology
カタログダウンロード
ライセンス形態
ハードウエア込み 永久ライセンス
他、お問合せください
新たにOncology３次解析が完成
-
腫瘍原性分類
-
AMP 分類
-
Kataegis 解析
-
腫瘍遺伝子変異量 (TMB)
Insight Oncology 三次解析 機能概要
腫瘍原性分類
-
体細胞変異の病原性分類*に対応
-
ユーザーによる個別のカテゴリを上書き ・ 修正し、最終評価を再計算が可能
* Peter Horak et al. Standards for the Classification of Pathogenicity of Somatic Variants in Cancer (Oncogenicity): Joint Recommendations of Clinical Genome Resource (ClinGen), Cancer Genomics Consortium (CGC), and Variant Interpretation for Cancer Consortium (VICC)
AMP分類
バリアントを次の カテゴリに分類します*
-
Tier1A: FDA 承認の治療法が専門のガイドラインに含まれている
-
Tier1B: 当該分野の専門家のコンセンサスがある十分に有力な研究がある
-
Tier2C: 異なる腫瘍タイプに対する FDA 承認の治療法または治験中の治療法
-
Tier2D:前臨床試験段階 または 少数の コンセンサスのない症例報告のみ
* Marilyn M. Li et al. Standards and Guidelines for the Interpretation and Reporting of Sequence Variants in Cancer: A Joint Consensus Recommendation of the Association for Molecular Pathology, American Society of Clinical Oncology, and College of American Pathologists
Kataegis 解析
Kataegis 解析は、一部のがんゲノムで知られる局所的な高頻度変異のパターンをユーザーが発見することが可能
-
がんの種類またはサブタイプを特定を支援
-
予後のマーカーとしても機能し、治療の選択を支援
腫瘍遺伝子変異量解析
Tumor Mutation Burden
腫瘍遺伝子変異量 (TMB) とその臨床的意義
-
腫瘍検体 DNA 内の体細胞変異の数を測定します。
-
TMB が高いと、特定の免疫療法に対する反応が良くなります。
2つの方法で TMB を計算
-
TMB 遺伝子コード領域: 腫瘍サンプルの遺伝子コード領域のすべての体細胞変異をTMB計算に含めます。
-
TMB 非同義変異: 腫瘍サンプルの非同義（アミノ酸変化を伴う）体細胞変異のみをTMB計算に含めます
変異シグネチャ解析
-
解析対象のサンプルについて、新規の変異シグネチャが抽出
-
抽出されたシグネチャは、COSMIC データベース 1 内で既知のシグネチャに対応付け
-
各シグネチャの変異プロファイルからは、考えられる病因や組織分布データなどの情報取得
Insight Oncology 解析パイプライン
-
多彩なアノテーションデータベースで高度なアノテーション
-
OMIM, Cosmicはカスタムデータベースとして利用可能
-
その他、カスタムデータベースに対応可能
-
オプションでファーマコゲノミクスやRNA解析が可能
従来の遺伝病解析機能も充実
-
機械学習モデルで変異の優先付け
-
AACMG 偶発的所見
Insight Hereditary: 三次解析 機能概要
-
多彩なアノテーションデータベースで高度なアノテーション
-
OMIM, Cosmicはカスタムデータベースとして利用可能
-
その他、カスタムデータベースに対応可能
-
オプションでファーマコゲノミクスやRNA解析が可能
ラインナップ
CompStor® Personal
デスクトップタイプ
シングルユーザー 手動で解析を実行できるように設計されたデスクトップベースのタワー型ワークステーション
導入しやすい低価格を設定しました。
小規模解析
マルチオミックス基礎研究を目的別サポート
基礎研究・ProやWorkgroup導入に向けた条件検討など
CompStor® Pro / Workgroup
ラックサーバータイプ データセンターでも設置に可能
自動化されたワークフロープロセス複数グループ・複数ユーザーで利用できます。
Pythonによる処理パイプラインの構築などに対応しています。
■ １台で２次解析と３次解析が両方できるオールインワンシステム
CompStor SpectrumTM Pro
CompStor SpectrumTM Workgroup
■ ２次解析と３次解析を独立サーバーで行うエンタープライズシステム
CompStor Novos® Pro（２次解析用）
CompStor Insight® Pro（３次解析用）
CompStor Insight® Workgroup（３次解析用）
