FluGASReport

Tablet をおすすめします。
https://ics.hutton.ac.uk/tablet/
そのほか、
Genomics Work Bench
UGENE http://ugene.net/
ncbi work bench https://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/gbench/tutorial6/
が利用できます。
*リファレンスファイルを指定する必要があります。

*お返しするデータには、下記以外のお客様の利用しないシステムファイルやログファイルが含まれています。

Directory	File/Sub Directory	Description
	①　sub type	検体中のインフルエンザウイルスの亜型をHA遺伝子-NA遺伝子の順で記載しています。 2種類以上の異なったウイルスゲノム配列が作成された場合、平均カバー率の高い順に（）内に並べて表記します。例：H3N2 HA(3-3-#) NA(2-#-#)＝H3N2亜型のA型インフルエンザウイルスが検出されています。HA遺伝子には2つの異なったゲノム配列が作成されており、どちらもHA3であることを示しています。