ソフトウェア&データベース
LSKB Chemotargets CLARITYk OFF-X COMA MetaGenome@KIN Metatranscriptome@KIN FluGAS OMIXON HLA Typing CLC Genomics Workbench/Server NEXUS CNV NEXUS TCGA Premier ADPKD Target |
歯科用メタゲノム解析パッケージ
歯科用メタゲノム解析ソフト 販売受付開始しました。
COMAは、メタゲノム解析ソフトMetagenome@Kinを歯科専用に改良したソフトウェアで、 口腔内細菌をNGSでシーケンスした16Sメタゲノムデータを元に解析します。
齲歯や歯周病に関連する菌、さらに全身疾患に関連する病原菌の存在比の表示と、 存在比を元にしたリスク判定が一度にできます。 COMAデータベース
COMAには、 HOMD(Human Oral Microbial Database)をベースとして、
キュレーションして開発した独自データベースCOMAD(Clinical Oral Metagenome Analysis Database)を搭載しています。
COMADは、歯科領域疾患に重要な約400菌種(約1,300配列種)を搭載しており、おもな菌には疾患との関連性を論文情報を
もとにアノテーション付けを実施。 ![]() リスク判定レポートリスク判定用のレポートでは、疾患との関連が明白なRed Complexなど、歯周病菌に関する約35菌種を、独自にTier1、Tier2、Tier3に 分類している。Red Complexなどを含む歯周病と齲歯に関連する菌種をTier1、その他の歯周病や齲歯に関連する菌種をTier2、内科疾患など、 歯周病以外の疾患に関連する菌をTier3としています。リスク判定基準は設定を変更することが可能です。 ![]() ![]() データベースの追加自分で新たな菌を登録できます。登録した菌はTier1、Tier2、Tier3のレポートに反映可能。配列やコメント、関連疾患名とともに簡単に登録できます。 ![]() ![]() ![]() |